Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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