Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pik3c3Q6PF93 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3c3Q6PF93 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms