Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gramd2bQ6PEM6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms