Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms