Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc66Q6NS45 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc66Q6NS45 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc66Q6NS45 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms