Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt39Q6IFX4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt39Q6IFX4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt39Q6IFX4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt39Q6IFX4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt39Q6IFX4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms