Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6DFW0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6DFW0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6DFW0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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