Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Usp7Q6A4J8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Usp7Q6A4J8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Usp7Q6A4J8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp7Q6A4J8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Usp7Q6A4J8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Usp7Q6A4J8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Usp7Q6A4J8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Usp7Q6A4J8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp7Q6A4J8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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