Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Samd9lQ69Z37 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Samd9lQ69Z37 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Samd9lQ69Z37 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Samd9lQ69Z37 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms