Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab3ipQ68EF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3ipQ68EF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3ipQ68EF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 542.4 ms