Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q66JV7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q66JV7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q66JV7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q66JV7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q66JV7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q66JV7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q66JV7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q66JV7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q66JV7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q66JV7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q66JV7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q66JV7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q66JV7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q66JV7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q66JV7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q66JV7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q66JV7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q66JV7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q66JV7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q66JV7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q66JV7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q66JV7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q66JV7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q66JV7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q66JV7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q66JV7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms