Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Top2bQ64511 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Top2bQ64511 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2bQ64511 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms