Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a5Q63ZW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a5Q63ZW6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a5Q63ZW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms