Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sp4Q62445 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sp4Q62445 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp4Q62445 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms