Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nptx1Q62443 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nptx1Q62443 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms