Protein–RNA interactions for Protein: Q62376

Snrnp70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp70Q62376 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrnp70Q62376 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snrnp70Q62376 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms