Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sall3Q62255 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sall3Q62255 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sall3Q62255 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms