Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Spa17Q62252 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spa17Q62252 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms