Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbm38Q62176 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbm38Q62176 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbm38Q62176 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms