Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phox2aQ62066 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2aQ62066 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms