Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pafah1b2Q61206 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pafah1b2Q61206 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms