Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OclnQ61146 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OclnQ61146 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OclnQ61146 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms