Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vdac1Q60932 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms