Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ItgaeQ60677 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ItgaeQ60677 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms