Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd200r3Q5UKY4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms