Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubr3Q5U430 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubr3Q5U430 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms