Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NacadQ5SWP3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NacadQ5SWP3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
NacadQ5SWP3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NacadQ5SWP3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NacadQ5SWP3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms