Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsr1Q5SWD9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms