Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r195Q5SVD6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms