Protein–RNA interactions for Protein: Q4G5Y1

Klhdc2, Kelch domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc2Q4G5Y1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc2Q4G5Y1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhdc2Q4G5Y1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhdc2Q4G5Y1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms