Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt35Q497I4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt35Q497I4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Krt35Q497I4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms