Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
4930596D02RikQ3V0H9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms