Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tbc1d9Q3UYK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbc1d9Q3UYK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tbc1d9Q3UYK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms