Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc114Q3UX62 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc114Q3UX62 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms