Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
B230104I21RikQ3USW4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms