Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbsponQ3UPR9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbsponQ3UPR9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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