Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skap2Q3UND0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skap2Q3UND0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms