Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trip13Q3UA06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms