Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem35bQ3U0Y2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem35bQ3U0Y2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms