Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms