Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a5Q3TYU2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a5Q3TYU2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a5Q3TYU2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a5Q3TYU2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a5Q3TYU2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a5Q3TYU2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a5Q3TYU2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms