Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pip4p1Q3TWL2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pip4p1Q3TWL2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms