Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300lgQ1ERP8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300lgQ1ERP8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300lgQ1ERP8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300lgQ1ERP8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd300lgQ1ERP8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd300lgQ1ERP8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms