Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YLR345WYLR345W 1530 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PUT2YHR037W 1728 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 GLN4YOR168W 2430 nt4.4□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PHO92YDR374C 921 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 KTR2YKR061W 1278 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 UBI4YLL039C 1146 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 NSE1YLR007W 1011 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 RAD10YML095C 633 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YMR010WYMR010W 1218 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 CCS1YMR038C 750 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 CPR8YNR028W 927 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YTA6YPL074W 2265 nt4.4□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 AIM6YDL237W 1173 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YFL012WYFL012W 447 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 DDI2YFL061W 678 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YGR219WYGR219W 342 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 GPP1YIL053W 753 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YIL165CYIL165C 360 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 ERG20YJL167W 1059 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 HOT13YKL084W 351 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 DDI3YNL335W 678 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 IMA3YIL172C 1770 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 IMA4YJL221C 1770 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 THI7YLR237W 1797 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 RNY1YPL123C 1305 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 KAP114YGL241W 3015 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YEH2YLR020C 1617 nt4.39□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 KEG1YFR042W 603 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YGR015CYGR015C 987 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 SFH5YJL145W 885 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 TVP38YKR088C 1014 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 CDC73YLR418C 1182 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 ECM23YPL021W 564 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 APA1YCL050C 966 nt4.38□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 LAS21YJL062W 2493 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 NUP2YLR335W 2163 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YMR221CYMR221C 1515 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 RNA15YGL044C 891 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 PEX14YGL153W 1026 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YGL193CYGL193C 312 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YJL220WYJL220W 453 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YAP7YOL028C 738 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 SRL4YPL033C 846 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 REI1YBR267W 1182 nt4.37□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 GSY1YFR015C 2127 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 PER1YCR044C 1074 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 EST3YIL009C-A 546 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 RPS1BYML063W 768 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 VPS20YMR077C 666 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 MPD1YOR288C 957 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 SPS4YOR313C 1017 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 TAF3YPL011C 1062 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 MRPL37YBR268W 318 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YJR026WYJR026W 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YJR028WYJR028W 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YAR010CYAR010C 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YML040WYML040W 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YMR051CYMR051C 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.36□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 CTT1YGR088W 1689 nt4.35□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 STV1YMR054W 2673 nt4.35□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 SPR6YER115C 576 nt4.35□□□□□ -1.71
UBX3Q12229 NPY1YGL067W 1155 nt4.35□□□□□ -1.71
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