Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp2b3Q0VF55 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp2b3Q0VF55 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms