Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cab39Q06138 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms