Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkczQ02956 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkczQ02956 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkczQ02956 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms