Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SelpQ01102 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SelpQ01102 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SelpQ01102 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelpQ01102 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelpQ01102 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelpQ01102 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SelpQ01102 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms