Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbp4Q00724 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp4Q00724 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp4Q00724 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms