Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gabpb1Q00420 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabpb1Q00420 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms